Bendera nasional Samoa pertama tampaknya telah diadopsi pada tanggal 2 Oktober 1873. Di latar belakang merah terdapat tanda silang putih yang membentang ke tepi bendera, serta sebuah bintang putih di sudut kerekan atas. Simbolismenya tidak diketahui, tetapi salib dan bintang mungkin masing-masing mewakili agama Kristen dan kemerdekaan. Raja Tamasese, yang menyukai Jerman yang mengunjungi daerah tersebut, kemudian mengubah bendera nasional dengan menempatkan salib hitam di atas bendera putih, memberikan warna merah-putih-hitam Jerman ke Samoa. Bendera itu digunakan dari tahun 1886 hingga 1889, tetapi tidak lagi digunakan setelah kematian Tamasese. Amerika Serikat dan Jerman membagi pulau-pulau itu pada tahun 1900 dan mendirikan protektorat terpisah di mana bendera lokal tidak dianjurkan.
Pada awal abad ke-20, bekas wilayah Jerman dikelola oleh Selandia Baru. Bendera lokal untuk pulau-pulau ini dikembangkan yang mencerminkan bendera Selandia Baru dalam warna merah-putih-biru, konstelasi Salib Selatan, dan desain bidang-dan-kanton. Diperkenalkan pada tanggal 26 Mei 1948, bendera baru Samoa berwarna merah dengan empat bintang putih di kanton biru; pada 24 Februari 1949, bintang kelima ditambahkan. Salib Selatan telah menjadi lambang bendera yang populer di negara lain di Belahan Bumi Selatan. Ini digunakan, misalnya, oleh Australia, Selandia Baru, dan Brasil. Dalam bendera Samoa, putih berarti kesucian, biru untuk kebebasan, dan merah untuk keberanian. Tidak ada perubahan yang dilakukan pada bendera nasional ketika negara merdeka pada 1 Januari 1962.
